据报导,麻省理工学院(mit)成立药物研发合成之机器学习协会(mlpds),试图改变药物研发制造流程,目前已有8个产业合作伙伴,皆为制药领域龙头,包括amgen、basf、bayer、lilly、novartis、pfizer、sunovion和wuxi等。
药物研发所费不赀又耗时,但机器学习可望分析大量化学资料,提高研发效率,对于研发流程和结果皆有帮助。mlpds协会将结合mit研究团队和产业的力量,首要目标是把机器学习引进药物研发流程中。
2018年4月时,mit举办高峰会,由计算机科学教授regina barzilay和电子工程教授erna viterbi等人领军,召集mit研究者以及科技、生技和管制单位的龙头,探讨如何以数码科技和人工智能(ai)克服生物医疗和医疗照护的重大挑战。
mlpds协会起初受到美国国防高等研究计画署(darpa)make-it计画所资助,目标是以机器学习和自动系统来合成药物,先后于2017年5月和9月跟制药产业的企业代表会商,无论产业界或mit皆有浓厚兴趣展开合作。
材料科学工程教授klavs jensen表示,合作厂商满怀热忱,加上机器学习技术潜力无限,这些将是化学和制药产业科学家的强力后盾,机器学习有助于规划化学合成路径,带领我们探索新的化学领域,提升化学的多样性,将更有机会找出具备特殊功能的化合物。
2018年5月mlpds协会再度聚集产业合作伙伴,透过教学和合作研究计画,让他们对于机器学习有基本概念。barzilay为大家讲授基础的监督式学习(supervised learning),亦即机器学习的其中一种方法,也涵盖神经模型和表征学习(representation learning)。
barzilay表示,只是刚开始探索这个新领域,但未来潜力无穷,可望改善人们的生活,这次跟制药产业合作,相信会是合作顺利的关键,他向来从产业界获益良多,发现不少值得思考的新问题。
协会的目标之一是建立评估标准和标竿资料集,以确认机器学习方法的准确度,目前大多数研究团队都是基于内部资料集来进行评估,有碍不同模型之间互相比较,进而拖慢科学进程,更糟糕的是,公开资料及通常无法呈现制药研究所面对的复杂性。
mit透过新协会进行跨领域合作,包括机器学习、化学和化学工程等。这对于新科技的研究者和使用者都有好处,有助于了解目前的发展程度,以及机器学习新科技的发展潜力。jaakkola也表示,结合现代机器学习技术和化学知识,可望开启药物研发、改良和合成的新途径。
化学工程研究生connor coley表示,虽然药物合成规划软件由来已久,但仍未获得广泛采用,合成规划对于初期药物研发阶段至关重要,可快速发现新的合成策略,减少反复研发、合成、测试的时间。
合作厂商也看好机器学习技术的潜力,amgen的shawn walker表示,机器学习可望加速药物研发,更快速把新药交到病患手上。诺瓦德氏生物医疗研究机构(nibr)表示,他们很期待加入mit所成立的新协会,可望加速制作更安全而有效的药物。
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