为什么基因组是决定一个人特征的独特遗传密码
由nvidia dgx系统提供动力的group 42超级计算机推动了国家基因组计划的实施，用来增进对阿联酋公民基因组的了解，提升医疗水平并抗击covid-19。
您有没有想过，人体究竟由什么构成的？
基因组是决定一个人特征的独特遗传密码，dna分子的特殊组合造就了每个独一无二的人。
研究一个人或一群人的整个遗传密码可以帮助我们更好地了解疾病，并通过启用精确医学和强大的药物基因组学，研究基因如何影响人体对药物的反应。
作为abu dhabi’s department of health发起的一项国家项目的一部分，group 42正在利用artemis超级计算机来解码人类基因组，并改善患者护理。由nvidia gpu支持的artemis是世界上速度第26快的系统。
总部位于阿布扎比（abu dhabi）的g42开发并部署了全面的、可扩展的ai和云计算产品，并通过 inception 人工智能研究所，对ai、大数据和机器学习进行了基础研究。
打造世界一流的ai超级计算机通常需要6个月或更长时间。在短短三周的时间里，g42通过dgx superpod参考架构和mellanox ai网络架构，与nvidia设计、构建和部署了artemis。
人口基因组计划
artemis内置81个nvidia dgx系统，总共可以提供7.2 petaflops的双精度hpl性能，并且运行的工作负载比g42以前的系统快120倍。
现在，超级计算机正在被用于“人口基因组计划（population genome program）”，该计划旨在深入对阿布扎比人口基因组的科学了解，并改善该国的医疗保健情况。
迄今为止，由于缺乏高质量的阿联酋参考基因组，对阿拉伯人口遗传变异的了解一直是一个挑战。人口基因组计划将通过合成阿联酋公民的参考基因组，来丰富可用数据。
该计划旨在成为世界上第一个将此作为基准，并将基因组数据纳入医疗管理流程的计划。
阿布扎比卫生部主席h.e. sheikh abdulla bin mohamed al hamed在一份新闻声明中指出：“拥抱创新并提供全面的医疗保健计划仍然是我们的首要任务。世界上最令人兴奋的两项技术——dna测序和ai，将在这个项目中融合。”
加速基因组数据处理
在该计划的第一阶段，将测试10，000个人的基因组。为了确保最准确地进行分析，将利用g42与bgi和oxford nanopore，这两个全球基因组测序领导者的合作，使用短读和长读基因组测序平台。
首先将采用oxford nanopore promethion测序仪进行匿名dna样本的收集和处理。这些设备包含嵌入式nvidia gpu技术，可启用边缘ai，这有助于加速基因组数据的处理。
处理后的数据将以图形格式提供给artemis进行ai分析，同时，借助nvidia parabricks软件，将会得到人口分析的相关支持。
最终结果将提供给研究机构和医学界，以帮助其为患者提供更有效的护理。这可能包括针对癌症、精神分裂症、自闭症、心血管和神经元疾病等疾病的更先进治疗。
g42基因组计划主管min s. park说：“借助nvidia的gpu技术，我们能够为国家人口基因组计划提供高度优化的ai平台，并加速数据处理。这项合作支持了我们制定整个阿联酋个性化护理计划的目标，将专家、数据和技术整合在一起，以改善患者护理。”
抗击疫情
最近，为了抗击covid-19疫情，g42还利用其超级计算能力，在阿布达比马斯达尔城（masdar city）建立了一个新的检测实验室。该实验室每天可以支持数以万计的实时逆转录聚合酶链反应（rt-pcr）测试。这些测试检测了从患者身上采集的样本中，是否存在sars-cov-2病毒。
此外，g42还参与covid-19诊断试剂盒的生产、热传感器的供应，并与当地和国际卫生当局合作，协助制定有效的预防和检测方案以控制该病毒。
g42首席执行官peng xiao表示：“技术将在遏制冠状病毒的传播中发挥关键作用，而artemis的卓越计算能力可以在许多方面提供帮助：从快速疫苗开发（计算机模拟可以代替人工实验，并缩短疫苗开发时间）到绘制并预测爆发趋势，以及预测病毒突变。”
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首先将采用oxford nanopore promethion测序仪进行匿名dna样本的收集和处理。这些设备包含嵌入式nvidia gpu技术，可启用边缘ai，这有助于加速基因组数据的处理。
处理后的数据将以图形格式提供给artemis进行ai分析，同时，借助nvidia parabricks软件，将会得到人口分析的相关支持。
最终结果将提供给研究机构和医学界，以帮助其为患者提供更有效的护理。这可能包括针对癌症、精神分裂症、自闭症、心血管和神经元疾病等疾病的更先进治疗。
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此外，g42还参与covid-19诊断试剂盒的生产、热传感器的供应，并与当地和国际卫生当局合作，协助制定有效的预防和检测方案以控制该病毒。
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